之前总有朋友问我，设计引物该用什么软件？我自己在实验室里捣鼓过不少次，经常遇到麻烦，比如计算出的引物不精准，导致实验老是失败，浪费材料和精力。上周，我终于抽时间做了个真实对比测评，目标就是搞清楚哪个引物设计软件真正好用，尤其是primer5和其他常见工具的对比。
一开头，我就想测试几个主流的软件
我先花半小时在电脑上搜了一圈，挑了几个大家常用的小工具：除了primer5，还选了另外三个免费软件，其中一个安装包超大，一个界面超级丑。我决定都下载试试看，毕竟不亲自上手，谁知道谁靠谱？下载过程就挺烦的，有个软件还得注册账号，填一堆信息，弄得我头晕脑胀。总算装好了，一共四个软件，放桌面排成一列。
测试的第一步，是看易用性
我打开primer5，界面挺清爽的，图标和按钮一目了然。导入DNA序列时，它自动跳出了输入框，我随便复制了一段从网站扒来的数据，点几下就换到另一个软件，卡了足足五分钟才加载出来，还时不时跳出提示让升级，搞得我心烦。剩下两个也没好到哪里去，一个图标小的看不见，另一个菜单藏得太深，得点老半天才找到功能。这样一比较，primer5上手最快，新手用着不折腾。
- primer5操作快：一点就通，没额外步骤。
- 其他工具太磨叽：老弹出广告或要求安装插件。
然后就是核心功能，设计引物的精准度
我把同一段DNA序列输入所有软件，手动调整了长度范围，想生成引物。primer5这边，它自动计算出了引物长度，还给出了匹配度百分比，看着挺靠谱。导出结果时，格式也规整，直接能存成文本文件。另一个软件出了问题，设计出的引物数值有偏差，我拿去实验室试了下，结果跑实验失败了。这还浪费了我早上三四个小时重复测试。剩下两个更糟糕，一个显示结果不完整，另一个干脆乱码了，还得重新搞。
这里花的时间最久，我反复试了五次不同的序列，发现primer5一直表现稳定，不会忽好忽坏。
测速度和稳定性
开所有软件同时运行，看谁不卡顿不崩溃。primer5跑起来飞快，几秒钟输出结果，CPU占用也不高。其它工具一开多任务就慢成蜗牛，甚至有个直接闪退了两次，害得我重装系统补丁才搞定。这部分的感受就一条：用primer5省时间，尤其是赶实验报告的时候。
- primer5速度快：秒出结果，无延迟。
- 其他软件常死机：加载时卡卡停停，影响效率。
做完测评，结论就简单了
primer5综合表现最操作简单、结果精准、运行稳定，其他软件一对比就成了陪衬。我之所以大费周章搞这个测试，是因为上回在实验室里，引物设计出错被老板骂过一回。那时候用一个免费工具，弄错长度数据，害得我加班两晚重复实验，样本全浪费了。从那以后，我就自己动手测东西，分享出来帮人避坑。要我说，想省事就用primer5，千万别瞎折腾
